Vesi-osio sisältää tietoa vesistöistä ja vesivaroista sekä niiden tilasta, seurannasta, käytöstä ja kunnostuksesta. Osiossa esitellään myös vesiensuojelua ja yhteistyötä. Tietoa vesiensuojelun lainsäädännöstä ja ohjelmista sekä strategioista löydät ympäristöministeriön sivustolta. Tutkimusnäkökulmaan voi tutustua SYKEn palvelussa. Tärkeä portti vesiaiheiseen tietoon on myös Järvi-meriwiki.
Vuonna 2020 otettiin käyttöön uusi vesi.fi-verkkopalvelu, josta vastaa SYKEn ja Ilmatieteen laitoksen Tulvakeskus yhteistyössä vesialan asiantuntijaorganisaatioiden kanssa. Palvelusta löytyy uuden karttapalvelun lisäksi ajankohtaista tietoa vesitilanteesta, vesihuollosta ja vesistötoimista kaikille kiinnostuneille. Sisältöä laajennetaan jatkuvasti.