Kainuun vesienhoidon yhteistyöryhmään kuuluu 32 jäsentä ja sen puheenjohtajana toimii Kainuun ELY-keskuksen Ympäristön kehittäminen -yksikön päällikkö Kari Pehkonen . Yhteistyöryhmä koostuu vesien käyttöön, suojeluun ja tilaan vaikuttavista keskeisistä valtion ja kuntien viranomaisista, tutkimuslaitoksista, elinkeinon harjoittajista, järjestöistä, vesialueiden omistajista sekä vesien käyttäjistä.